ผู้ประกอบการตรวจสอบมาตรฐาน แบ่งเป็น 2 ประเภทได้แก่ ผู้ประกอบการตรวจสอบมาตรฐานประเภทหน่วยรับรอง (สามารถออกใบรับรองมาตรฐาน มกษ. ให้ท่านได้) และผู้ประกอบการตรวจสอบมาตรฐานประเภทหน่วยตรวจ (ไม่สามารถออกใบรับรองมาตรฐานให้ท่านได้)
ผู้ประกอบการตรวจสอบมาตรฐานประเภทหน่วยรับรอง ยังแบ่งออกได้เป็น
CA (Competent Authority) หมายถึง หน่วยงานที่มีอำนาจหน้าที่ ในบทความนี้ CA จะหมายถึงหน่วยรับรองภาครัฐที่มีอำนาจหน้าที่ตามภารกิจหลักของหน่วยงานในการตรวจสอบรับรองมาตรฐานให้กับเกษตรกร หรือผู้ประกอบการผลิตสินค้าเกษตร เช่น กรมปศุสัตว์ กรมประมง กรมวิชาการเกษตร การยางแห่งประเทศไทย เป็นต้น
CB (Certify Body) หมายถึง หน่วยรับรองที่ต้องขออนุญาตเป็นผู้ประกอบการตรวจสอบมาตรฐานจาก มกอช. จึงสามารถให้การตรวจสอบและรับรองตามมาตรฐานสินค้าเกษตรได้
